1、預凍：在將相關制品放入凍干機后的第一個步驟，將制品冷凍到很低的溫度，一般為-30℃以下（比物料的共晶點低5～10℃），目的是將制品中自由水固化。預凍的速度根據制品性質及需求選擇，冷凍速率會影響冰晶大小，冰晶大小又會影響后續干燥和干燥后產品溶解度，因此要注意選擇合適的降溫速率。冷凍到要求溫度后，保持一段時間，使制品*凍結。

關鍵參數：冷凍速度、冷凍溫度、冷凍保持時間。

2、升華干燥：這是凍干過程最重要步驟，主要是進行抽真空，一般真空度為10～30Pa，使制品升華點降低。同時，在這個過程會給制品加熱，用于提供冰晶升華所需熱量。控溫要求很嚴格，必須保證升華溫度不能超過物料的共晶點，同時要低于干燥物料的崩解溫度。

關鍵參數：真空度、控溫溫度及溫度分布、升華速率。

3、解析干燥（二次干燥）：升華干燥完成后，就進入解析干燥階段，主要功能是去除制品中游離水，提高脫水率。

4、后處理：實際是凍干過程結束了，后面的一些卸料出貨過程，至此整個凍干過程也就結束了。